Ο κ. Κουράκης χαρακτήρισε "καταστρεπτικές για την πόλη" αυτές τις παρεμβάσεις, οι οποίες αφορούν τα εξής:

1. Περιτοίχισμα Λευκού Πύργου. Παρά την αντίθετη γνώμη των αρχαιολόγων της πόλης, το Κεντρικό Αρχαιολογικό Συμβούλιο (ΚΑΣ), με τη διπλή ψήφο του κ. Ζαχόπουλου, αποφάσισε, κατά πλειοψηφία, την κατάχωση του περιτοιχίσματος του Λευκού Πύργου. Την επομένη ο κ. Ζαχόπουλος, κατά παράβαση κάθε δεοντολογίας που θέλει την απόφαση του ΚΑΣ απλώς γνωμοδοτική στον υπουργό, ανακοίνωνε στον Τύπο την έναρξη εκτέλεσης του έργου. Τελικώς, μετά την παρέμβαση φορέων, ο υφυπουργός κ. Τατούλης ματαίωσε τα σχέδια του κ. Ζαχόπουλου.

2. Οικοδόμηση χώρου του βρεφοκομείου "Αγ. Στυλιανός". Με απόφαση του ΚΑΣ και παρά τη γνώμη της Αρχαιολογικής Υπηρεσίας δόθηκε το πράσινο φως για ανέγερση οικοδομής γραφείων και καταστημάτων, ιδιοκτησίας της ισραηλινής κοινότητας, ακυρώνοντας έναν ακόμη ελεύθερο χώρο της πόλης, και υποσκάπτοντας την ψυχική υγεία των παιδιών που φιλοξενούνται.

3. Γερμανικό προξενείο. Με απόφαση του κ. Ζαχόπουλου δόθηκε άδεια για την ανέγερση οκταώροφης πολυκατοικίας που είχε εγκριθεί επί κυβερνήσεων ΠΑΣΟΚ το 1999 και είχε παγώσει έπειτα από αντιδράσεις κατοίκων και φορέων της πόλης, κατά παράβαση νόμου του 1980 που προέβλεπε στο συγκεκριμένο χώρο την ανέγερση μόνο μικρού κτιρίου του γερμανικού προξενείου.

4. Πάρκιγκ της πλατείας Διοικητηρίου. Με απόφαση του ΚΑΣ αποφασίστηκε ο αρχαιολογικός χώρος να αποτελέσει τον κάτω όροφο τριώροφης κατασκευής, με χώρο πάρκιγκ άνωθεν και πλατεία στο πάνω επίπεδο, παρά τις αντιρρήσεις φορέων και αρχαιολόγων της πόλης, που αξίωναν την αυτοτελή ανάδειξη του μνημείου.

5. Αποχαρακτηρισμός κτιρίων στο λιμάνι της Θεσσαλονίκης από το ΚΑΣ. Για τις ανάγκες της υποθαλάσσιας αρτηρίας και με αρνητική γνωμοδότηση της Εφορείας Νεωτέρων Μνημείων αποφασίστηκε από το ΚΑΣ ο αποχαρακτηρισμός τους. Οι "Πολίτες κατά της Υποθαλάσσιας" προσέφυγαν στο Συμβούλιο της Επικρατείας και εκκρεμεί η τελική απόφαση.

6. Η ανέγερση οικοδομής πάνω στο τείχος της Θεσσαλονίκης. Σε οικόπεδο της εκκλησίας στη συμβολή της οδού Τσιμισκή και Φιλικής Εταιρείας μετά από απόφαση του ΚΑΣ αποφασίστηκε η ανέγερση οικοδομής, η οποία σήμερα εκτελείται, παρόλο που σε παρακείμενο οικόπεδο είναι εμφανής η παρουσία του μνημείου.

7. Δενδροφύτευση γύρω από ιστορικά μνημεία. Στις 11 Δεκεμβρίου 2007 υπογράφηκε από τον κ. Ζαχόπουλο κονδύλιο 30.000 ευρώ για μελέτη έργου δεδροφύτευσης ιστορικών μνημείων της Θεσσαλονίκης (κηπευτική μελέτη) κατασκευαστικής αξίας 2,5 εκατομμυρίων ευρώ, ώστε να περιληφθεί στο Γ' ΚΠΣ και να συνεχιστεί στο Δ' ΚΠΣ. Ο υπουργός κ. Λιάπης έχει ενημερωθεί από μηχανικούς της υπηρεσίας να μην υπογράψει αυτή τη δαπάνη, καθώς η ανάγκη για την προστασία ιδιαίτερα των τεσσάρων χιλιομέτρων τειχών (σύμφωνα με τη γνώμη των ειδικών επιστημόνων) είναι πολύ πιο επιτακτική από τη δεδροφύτευση των ήδη δενδροφυτεμένων χώρων.